Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms