Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH5

NOX4, NADPH oxidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOX4Q9NPH5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NOX4Q9NPH5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms