Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-5Q9HDB9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms