Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf49Q9H741 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf49Q9H741 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms