Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SH3BGRL3Q9H299 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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