Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLIRPQ9GZT3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms