Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTMR12Q9C0I1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms