Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.7 ms