Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms