Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM55Q9BYV6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms