Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSDMCQ9BYG8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms