Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4AQ9BY43 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4AQ9BY43 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms