Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms