Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRIP1Q9BX63 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRIP1Q9BX63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms