Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms