Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDHD3Q9BSH5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms