Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms