Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms