Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITX2Q99697 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms