Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPS8Q99627 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms