Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3R4Q99570 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3R4Q99570 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms