Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM20AQ96MK3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM20AQ96MK3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms