Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SAMD8Q96LT4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD8Q96LT4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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