Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EP400Q96L91 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EP400Q96L91 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms