Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00208Q96KT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms