Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms