Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EDC3Q96F86 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDC3Q96F86 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms