Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHFRQ96EP1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms