Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms