Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 C16orf58-207ENST00000567578 636 ntTSL 421.67■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-203ENST00000541442 1056 ntTSL 221.67■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-212ENST00000472427 764 ntTSL 221.59■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PHLDB3-209ENST00000601646 546 ntTSL 321.48■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FARP2-217ENST00000479427 839 ntTSL 320.95■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 220.5■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PACS2-209ENST00000549030 1925 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FARP2-216ENST00000478489 617 ntTSL 320.28■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TRIM14-204ENST00000475147 639 ntTSL 220.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-202ENST00000319107 770 ntTSL 319.98■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 219.81■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SFXN5-214ENST00000482289 895 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-205ENST00000373439 1527 ntTSL 519.73■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-10■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TRIM14-205ENST00000478401 814 ntTSL 219.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 518.97■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SRCIN1-216ENST00000621763 5225 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PHLDB3-202ENST00000594808 627 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SPRED2-202ENST00000421087 701 ntTSL 318.65■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 218.58■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 218.33■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-202ENST00000421263 460 ntTSL 218.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE3D-207ENST00000509102 1246 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 318.24■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 517.72■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SDC2-205ENST00000520233 563 ntTSL 417.67■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 ARVCF-208ENST00000480792 551 ntTSL 317.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 35.3
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TBRG4Q969Z0 PACS2-206ENST00000547903 1157 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 317.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 C1orf226-201ENST00000420220 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.42■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 517.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 517.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 316.94■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 PUS7-204ENST00000481939 2436 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 416.83■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 35.3
TBRG4Q969Z0 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 35.3
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