Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TRIM63Q969Q1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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