Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRG4Q92954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms