Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTTNBP2Q8WZ74 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNBP2Q8WZ74 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms