Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSMEM1Q8WWF3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSMEM1Q8WWF3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms