Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRIM41Q8WV44 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRIM41Q8WV44 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms