Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA2Q8TDQ7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA2Q8TDQ7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms