Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNDC9Q8TBE3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms