Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD1Q8NHV4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms