Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM2BQ8NHM5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms