Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIEQ8NEW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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