Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC21AQ8NDW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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