Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms