Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSAMQ8N6F7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms