Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM20Q8N5G0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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