Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CMTM1Q8IZ96 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms