Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms