Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC117Q8IWD4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms