Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC84Q86UT8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms