Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTF1AQ7RTS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms