Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUFY3Q7L099 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUFY3Q7L099 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms